Bauble — менеджер коллекций биологических видов. Как установить?

[puyamolina]

Здраствуйте, товарищи! 

У меня очередная проблема (задача). Нашел замечательную программку, производства работника ботанического сада в Белизе.
Пакеты сушествуют только для Ubuntu и OpenSuse, для Slackware конечно же нет. Но, есть исходный код.
Также, указано, что (как я понял из перевода) необходимо установить предварительно — Python 2.4 , GTK 2.10 , PyGTK , SQLAlchemy и LXML , и Postgres , или SQLite.
К сожалению, я не смог разобраться с установкой этой программки из исходников.
Подскажите пожалуйста, как поставить эту программку!

Вот ссылка на сайт программки (единственная вроде страничка): http://www.belizebotanic.org/bauble/index.html

Заранее благодарен. 

[bormant]

Код Выделить Развернуть


# sbopkg -Rki "BeautifulSoup lxml SQLAlchemy pysetuptools"
# tar xf bauble-1.0.11.tar.bz2
# cd bauble-1.0.11
# mkdir -p /tmp/pkg-bauble
# python setup.py install --root=/tmp/pkg-bauble
# cd /tmp/pkg-bauble
# makepkg -l y -c n /tmp/bauble-1.0.11-x86_64-1sb.txz
# upgradepkg --install-new /tmp/bauble-1.0.11-x86_64-1sb.txz

Правда с определением версии SQLAlchemy у нее наличествует какой-то косяк:

Код Выделить Развернуть


$ bauble
...
File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/bauble/db.py", line 20, in <module>
    raise error.SQLAlchemyVersionError(msg)
bauble.error.SQLAlchemyVersionError: SQLAlchemyVersionError: This version of Bauble requires SQLAlchemy 0.6 or greater. You are using version 0.9.4. Please download and install a newer version of SQLAlchemy from http://www.sqlalchemy.org or contact your system administrator.
Как вариант -- писать разработчикам, исправлять самому или пытаться собрать/поставить SQLAlchemy желаемой версии.

[Graf]

Ну, во-первых:

This project has been discontinued

Latest version is 1.0.11
released on 2011-11-25

там же советуют использовать веб приложение с https://github.com/Bauble.

По поводу предложенных сырцов (довольно старых), собираются они просто и недостающие компоненты подкачиваются автоматически скриптом установки. Но все эти компоненты, обычно, последних версий. В итоге, при запуске имеем следующее:

Код Выделить Развернуть


$ bauble

bauble.error.SQLAlchemyVersionError: SQLAlchemyVersionError: This version of Bauble requires SQLAlchemy 0.6 or greater.
You are using version 0.9.4. Please download and install a newer version of SQLAlchemy from http://www.sqlalchemy.org or
contact your system administrator.


Хоть здесь и сказано 0.6 или выше, но для него 0.9.4 явно ниже , а ниже 0.8 версий уже нет.

зы: bormant опять опередил
кстати, его вариант сборки самый слако-правильный.

[bormant]

Проверку версии исправить несложно, см. строку 20 в ./bauble/db.py:

Код Выделить Развернуть


-    if int(parts[1]) not in (6,7):
+    if int(parts[1]) not in (6,7,8,9):
Теперь пересобрать исходники, пересобрать пакет (увеличить tag или не забыть --reinstall в upgradepkg), переустановить пакет.

Следующим вопросом будет отсутствие python-dateutil, что лечится несложно:

Код Выделить Развернуть


# sbopkg -Rki "six python-dateutil"


Окошко подключения получил. Дальше не проверял.

PS. Если нужно подключение и к PostgreSQL, перед сборкой bauble нужно собрать и поставить postgresql и psycopg2 (на slackbuilds.org есть).

[puyamolina]

Ребята, спасибо за инструкцию, но у меня некоторые проблемы.

Код Выделить Развернуть

$ tar xf bauble-1.0.11.tar.gz                                             
tar: This does not look like a tar archive
tar: Skipping to next header
tar: Exiting with failure status due to previous errors
Вроде-как не понимает тип архива? Как лечится?

[Graf]

Стесняюсь спросить

Код Выделить Развернуть

# tar --version

[puyamolina]

Код: [Выделить]

# tar --version

Код Выделить Развернуть

$ tar --version
tar (GNU tar) 1.26
Copyright (C) 2011 Free Software Foundation, Inc.
License GPLv3+: GNU GPL version 3 or later <http://gnu.org/licenses/gpl.html>.
This is free software: you are free to change and redistribute it.
There is NO WARRANTY, to the extent permitted by law.

Written by John Gilmore and Jay Fenlason.

[Graf]

Хм.. странно
Я брал ЭТОТ, нормально распаковывается.

[puyamolina]

Хм.. странно
Я брал ЭТОТ, нормально распаковывается.

Не поверите Только, что скачал по вашей ссылке (в тот же каталог, с заменой) — распаковался как положено. Это какое-то очень сильное колдунство.

[puyamolina]

А у меня вот:

Код Выделить Развернуть

bauble
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/bin/bauble", line 24, in <module>
    bauble.main()
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/bauble/__init__.py", line 188, in main
    import bauble.pluginmgr as pluginmgr
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/bauble/pluginmgr.py", line 29, in <module>
    import bauble.db as db
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/bauble/db.py", line 20, in <module>
    raise error.SQLAlchemyVersionError(msg)
bauble.error.SQLAlchemyVersionError: SQLAlchemyVersionError: This version of Bauble requires SQLAlchemy 0.6 or greater. You are using version 0.9.4. Please download and install a newer version of SQLAlchemy from http://www.sqlalchemy.org or contact your system administrator.
Это наверное то, о чем, писал bormant? Я правда, так и не сообразил, как это лечится. 

[Graf]

Это какое-то очень сильное колдунство.

Всё может быть... 

На самом деле просто тарбол не докачался или побит. 

[Graf]

Это наверное то, о чем, писал bormant? Я правда, так и не сообразил, как это лечится. 

До

Код Выделить Развернуть

# python setup.py install --root=/tmp/pkg-bauble

сделать

Код Выделить Развернуть

# sbopkg -Rki "six python-dateutil"

потом заменить ИСПРАВЛЕННЫЙ db.py в каталоге ./bauble распакованного архива

далее

Код Выделить Развернуть


# python setup.py install --root=/tmp/pkg-bauble
# cd /tmp/pkg-bauble
# makepkg -l y -c n /tmp/bauble-1.0.11-x86_64-1sb.txz
# upgradepkg --install-new --reinstall /tmp/bauble-1.0.11-x86_64-1sb.txz


[puyamolina]

Спасибо!  Окошко появляется, но при запуске, в консоли выдает6

Код Выделить Развернуть

bauble
connmgr.py(78): ConnectionManager: No module named psycopg2
__init__.py(239): EmptyDatabaseError
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.tag module.

No module named pyparsing
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.picasa module.

No module named gdata.photos.service
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.garden module.

No module named pyparsing
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.report module.

No module named pyparsing
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.report.mako module.

No module named pyparsing
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.report.xsl module.

No module named pyparsing
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.plants module.

No module named pyparsing
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.abcd module.

No module named pyparsing
Что-то с питоновскими модулями?

[Graf]

Код Выделить Развернуть

# sbopkg -Rki "pyparsing psycopg2 gdata"

[puyamolina]

Эта хреновина, это какой-то кошмар!
Запускается окно. Нажимаем «Add» — т. е., «создать базу данных». Потом, нажимаем «Connect» — вылезает окно вот с этим: «The database you have connected to is empty.», вроде как база ваша пустая. Нажимаешь «ОК» — закрывается программина.
В консоли:

Код Выделить Развернуть

$ bauble
__init__.py(239): EmptyDatabaseError
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.tag module.

cannot import name RelationProperty
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.picasa module.

cannot import name PropertyLoader
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.garden module.

cannot import name PropertyLoader
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.report module.

cannot import name PropertyLoader
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.report.mako module.

cannot import name PropertyLoader
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.report.xsl module.

cannot import name PropertyLoader
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.plants module.

cannot import name PropertyLoader
pluginmgr.py(544): Could not import the bauble.plugins.abcd module.

cannot import name PropertyLoader
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/bin/bauble", line 24, in <module>
    bauble.main()
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/bauble/__init__.py", line 264, in main
    pluginmgr.load()
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/bauble/pluginmgr.py", line 108, in load
    found, errors = _find_plugins(path)
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/bauble/pluginmgr.py", line 551, in _find_plugins
    if inspect.isfunction(mod.plugin):
AttributeError: 'function' object has no attribute 'isfunction'

В общем, беда сплошная. Может быть, чего-то еще не хватает?